복잡한 '마이크로바이옴 분석' 쉽고 빠르게...연세대, 新 분석도구 개발 작성일 01-26 50 목록 <div id="layerTranslateNotice" style="display:none;"></div> <div class="article_view" data-translation-body="true" data-tiara-layer="article_body" data-tiara-action-name="본문이미지확대_클릭"> <section dmcf-sid="QghyeAd8ss"> <figure class="figure_frm origin_fig" contents-hash="b73d975721d92cc42a5647e98f1a6aa584b86d5151ad0eb7463ba96c16b8bbdd" dmcf-pid="xalWdcJ6rm" dmcf-ptype="figure"> <p class="link_figure"><img alt="메타펀의 개발 모식도" class="thumb_g_article" data-org-src="https://t1.daumcdn.net/news/202601/26/etimesi/20260126120254411ffha.png" data-org-width="700" dmcf-mid="6EXQYpGhsI" dmcf-mtype="image" height="auto" src="https://img2.daumcdn.net/thumb/R658x0.q70/?fname=https://t1.daumcdn.net/news/202601/26/etimesi/20260126120254411ffha.png" width="658"></p> <figcaption class="txt_caption default_figure"> 메타펀의 개발 모식도 </figcaption> </figure> <p contents-hash="bfad78b0ff4821103d1fefe143a90b9c1e0f21c6b6b6a1577cb5a8b1ef2896f1" dmcf-pid="y9nNu471Ir" dmcf-ptype="general">장내 미생물 등 메타유전체(특정 환경의 모든 미생물 유전체 총합) 빅데이터를 쉽고 빠르게 분석할 수 있는 도구가 개발됐다. 마이크로바이옴 연구 문턱이 낮아질 전망이다.</p> <p contents-hash="b015e1d090641499fc9388b4fe903889f20d83b263727c2bd54815936be805d5" dmcf-pid="W2Lj78ztrw" dmcf-ptype="general">한국연구재단(이사장 홍원화)은 김지현 연세대 교수팀이 권순경 경상국립대 교수 등과 대용량 메타유전체 정보 기능 분석을 표준화·최적화한 통합 파이프라인 '메타펀(metaFun)'을 개발했다고 26일 밝혔다.</p> <p contents-hash="c3e77c21d7cb0e14076277793f95fb3449e116e8fe6d66e545e08020929bba29" dmcf-pid="YVoAz6qFrD" dmcf-ptype="general">인체 마이크로바이옴은 우리 몸 속 미생물의 집합이다. 그 군집의 구조·기능을 들여다볼 수 있는 메타유전체 분석 기술은 마이크로바이옴 연구 핵심으로 자리 잡았다. 하지만 분석 과정이 매우 복잡하고, 사용 프로그램이나 설정값에 따라 결과가 크게 달라지는 문제가 있다. 프로그램 사용 및 코딩에 익숙하지 않은 임상·생물학 연구자들이 특히 어려움을 겪었다.</p> <p contents-hash="0d36dd861dedb648f1edb4804234ed00bb0456d9a3fc409039287a245aa5a731" dmcf-pid="GfgcqPB3DE" dmcf-ptype="general">이에 연구진은 메타유전체 분석 전 과정에 대해 표준화하고 최적화한 데이터 해석 환경을 제공하는 분석 도구를 설계했다. 인체 장내, 식물 뿌리 토양, 해양 등 다양한 환경의 메타유전체 데이터를 활용한 대규모 테스트를 통해 최적의 분석 조건을 도출했다.</p> <p contents-hash="506d0a6a6542d28a593de8d4c69331e70fc39f1c9c50ac36086512240e3b418a" dmcf-pid="H4akBQb0Ek" dmcf-ptype="general">또 서로 다른 컴퓨터 분석 환경에서도 같은 결과를 얻을 수 있도록 최신 워크플로우 관리 기술(데이터 분석의 여러 단계가 끊김없이 수행되도록 관리하는 기술)과 컨테이너 기술(소프트웨어 실행 요소들을 패키지화한 가상화 기술)을 적용했다.<br></p> <figure class="figure_frm origin_fig" contents-hash="c80ecf357ee42860c5f1629a0774ab0808511c707a0ad9794cf3fd49cc46c8b4" dmcf-pid="X8NEbxKpEc" dmcf-ptype="figure"> <p class="link_figure"><img alt="개발 연구진. 왼쪽부터 정유숙 쎌바이오텍 이사, 권순경 경상국립대 교수, 이현권 연세대 박사후연구원, 김지현 연세대 교수, 윤재경 연세대 연구교수, 송주연 연세대 연구교수." class="thumb_g_article" data-org-src="https://t1.daumcdn.net/news/202601/26/etimesi/20260126120255715kjag.jpg" data-org-width="700" dmcf-mid="POtUESDgmO" dmcf-mtype="image" height="auto" src="https://img2.daumcdn.net/thumb/R658x0.q70/?fname=https://t1.daumcdn.net/news/202601/26/etimesi/20260126120255715kjag.jpg" width="658"></p> <figcaption class="txt_caption default_figure"> 개발 연구진. 왼쪽부터 정유숙 쎌바이오텍 이사, 권순경 경상국립대 교수, 이현권 연세대 박사후연구원, 김지현 연세대 교수, 윤재경 연세대 연구교수, 송주연 연세대 연구교수. </figcaption> </figure> <p contents-hash="72450d06b085511ed6627bc4d30a2c779e0df8960d00e9b9af691c2487cb9937" dmcf-pid="Z6jDKM9UDA" dmcf-ptype="general">이렇게 개발한 메타펀은 염기서열 데이터 품질 검사부터 미생물 종류 분석, 기능 분석, 균주 수준의 세밀한 분석, 유전체 조립과 분류, 유전체 품질 평가, 비교유전체학 분석에 이르는 총 7개 분석 단계를 효율적으로 수행한다.</p> <p contents-hash="b0de77112948f7371be6ebcbeb6e00b9f04a2c2e55bc0767e22dec1cf12a3dfa" dmcf-pid="5PAw9R2uEj" dmcf-ptype="general">또 분석 결과를 활용해 실시간 데이터 해석과 시각화를 지원하는 4개 대화형 모듈을 오픈소스로 제공해 비전문가도 코딩 기술 없이 결과를 이해할 수 있도록 했다.</p> <p contents-hash="591c6495ee8c1e44d5100a36fd14a0e6f3c97e51cb46fff913549e50336d454d" dmcf-pid="1Qcr2eV7ON" dmcf-ptype="general">관련 논문 제1저자인 이현권 박사는 “대장암 환자와 건강인의 장내 미생물 데이터를 이용한 메타펀 성능 검증에서 환자군과 건강인 간 뚜렷한 차이를 확인해 실제 연구에 활용 가능한 도구임을 입증했다”고 밝혔다.</p> <p contents-hash="cc68fa30fb9faa3bf7d4cd1c344793877afcb3d02f24523a7ffa16bee51f0ffe" dmcf-pid="txkmVdfzsa" dmcf-ptype="general">김지현 교수는 “개별 미생물 종류의 변화부터 군집 간 상호작용 네트워크, 나아가 균주 수준의 미세다양성까지 다층적으로 분석할 수 있어, 마이크로바이옴과 질병의 연관성, 환경에서의 역할 등을 보다 입체적으로 규명할 수 있을 것”이라고 설명했다.</p> <p contents-hash="63f4e384220a14fcd47b03b61903b29bc729884ac3514efce66703d7f79e8b0d" dmcf-pid="FMEsfJ4qDg" dmcf-ptype="general">과학기술정보통신부와 한국연구재단이 추진하는 바이오·의료기술개발사업 및 중견연구사업 등의 지원을 받은 이번 연구 성과는 '장내 미생물(Gut Microbes)'에 지난 13일 온라인 게재됐다.</p> <p contents-hash="ce3ca4163f3c33b2ac48e80529fe111f0f14592fac9f4a1931d7ec8e4ff5e758" dmcf-pid="3RDO4i8Bmo" dmcf-ptype="general">김영준 기자 kyj85@etnews.com</p> </section> </div> <p class="" data-translation="true">Copyright © 전자신문. 무단전재 및 재배포 금지.</p> 관련자료 이전 국내 연구진, ‘로봇팔 수전증’ 막는 기술 개발 01-26 다음 낡은 방송법 넘는다… OTT·유튜브 포괄하는 '시청각미디어서비스법' 윤곽 01-26 댓글 0 등록된 댓글이 없습니다. 로그인한 회원만 댓글 등록이 가능합니다.
